Тужилаштва у Републици Српској су организована у својим организационим јединицама и то одјељењима и одсјецима. Републичко јавно тужилаштво чини Опште одјељење које у свом саставу има: Одсјек за ратне злочине, Одсјек за општи криминал, Одсјек за привредни криминал и Одсјек за малољетнике и Посебно одљељење за сузбијање корупције, организованог и најтежих облика привредног криминала које је успостављено Законом о сузбијању корупције, организованог и најтежих облика привредног криминала.
Поред Републичког тужилаштва, организациону структуру чине и шест окружних јавних тужилаштава чија сједишта су у Бањалуци, Приједору, Добоју, Бијељини, Источном Сарајеву и Требињу.