Tužilaštva u Republici Srpskoj su organizovana u svojim organizacionim jedinicama i to odjeljenjima i odsjecima. Republičko javno tužilaštvo čini Opšte odjeljenje koje u svom sastavu ima: Odsjek za ratne zločine, Odsjek za opšti kriminal, Odsjek za privredni kriminal i Odsjek za maloljetnike i Posebno odljeljenje za suzbijanje korupcije, organizovanog i najtežih oblika privrednog kriminala koje je uspostavljeno Zakonom o suzbijanju korupcije, organizovanog i najtežih oblika privrednog kriminala.
Pored Republičkog tužilaštva, organizacionu strukturu čine i šest okružnih javnih tužilaštava čija sjedišta su u Banjaluci, Prijedoru, Doboju, Bijeljini, Istočnom Sarajevu i Trebinju.